12 мая 2023 года Президент России Владимир Путин подписал Указ «О некоторых вопросах совершенствования системы высшего образования», который предусматривает реализацию в 2023/24 и 2025/26 учебных годах пилотного проекта, направленного на изменение уровней профессионального образования. Томский государственный университет, среди шести ведущих российских университетов, единственный за Уралом, вошел в пилотный проект по реформированию системы высшего образования. Участие в пилотном проекте по совершенствованию системы высшего образования дает университету больше свободы при проектировании и реализации новых образовательных программ, отвечающих потребностям рынка труда. Участие ТГУ в пилотном проекте предусматривает реализацию новых уровней образования: базовое высшее образование и специализированное высшее образование. Срок обучения по программам базового высшего образования составляет от 4 до 6 лет. В качестве пилотных направлений по базовому высшему образованию были выбраны направления подготовки: 

Программная инженерия – 4 года

Журналистика – 4 года

Фундаментальная и прикладная химия – 5 лет

Мехатроника и робототехника – 5 лет

Прикладная механика – 5 лет

Баллистика и гидроаэродинамика – 5 лет

Техническая физика – 5 лет

Юриспруденция – 5 лет