Текущее руководство деятельностью университета осуществляет ректор, избранный решением конференции работников и обучающихся университета и назначенный учредителем на пять лет.
В состав ректората входят проректоры по учебной, научной, социальной, административно-хозяйственной работе, международной деятельности, программам развития и безопасности.
В основе управления университетом лежат следующие принципы:
- Все службы и должностные лица подчиняются ректору университета как первому руководителю вуза;
- Ректор осуществляет управление путем возложения ответственности и делегирования части своих полномочий исполнительному аппарату (ректорату).
Механизм реализации управленческих решений основан на вертикальной и горизонтальной инфраструктурах, при этом вертикальная (проректорская) инфраструктура обеспечивает сквозное и полное функционирование всех звеньев университетского комплекса, как правило, в одном направлении; горизонтальная инфраструктура решает вопросы всех (или многих) сторон жизнедеятельности университета.