1. АТЛАС БАК ЦЕРН (ATLAS CERN) - международная
2. ТОТЕМ БАК ЦЕРН (TOTEM CERN) - международная
3. КМС (Компактный мюонный соленоид) БАК ЦЕРН (CMS CERN) – международная ;
4. ИНТЕРАКТ (INTERACT) – международная
5. Мониторинг для прогнозирования на местах "Пан-Евразийский эксперимент" (PEEX Pan-Eurasian Experiment) – международная
6. СИВА-ДжейПиАйКлаймит (SIWA-JPIClimate) – международная
7. Институциональное партнерство в целях устойчивого трансграничного водопользования: Россия и Казахстан (TREASURE WATER) – международная
8. Сибирская Сеть по изучению изменений окружающей среды SecNET – международная
9. Университет Арктики (University of the Arctic) – международная
10. Форум операторов арктических исследований (FARO)
11. Исследовательская Сеть TTS CNRS (Tundra-to-Steppe)
12. Сеть водно-болотных экологических центров в рамках Рамсарской конвенции о водно-болотных угодьях (WLI Wetland Link International, Ramsar convention on wetlands)
13. Наземные мультидисциплинарные обсерватории для изучения климата Арктики (T-MOSAiC) – международная
14. Американская Национальная сеть экологических обсерваторий (NEON) – международная
15. Консорциум по исследованию загрязненных донных отложений; северных и арктических морей) CRENAME (Consortium of Researchers & Experts in North and Arctic Marine Ecosystems Oil Contamination) – международный
16. Высокоэнергетические материалы (High Energy Materials - HEMs) – международная
17. FCAL – коллаборация по исследованию и разработке детекторов – международная
18. Европейская Ассоциация Антропологов (European Anthropological Assosiation) – международная
19. Консорциум \"Доступная генетика\" (TAGC) – международный
20. КАР-ВЕТ-СИБ (CARWETSIB) – российско-французская
21. Франко-Сибирский Центр науки и образования
22. Национальный Арктический научный консорциум – российская
23. Альянс трансляционной медицины (АТМ) – российская
24. Ассоциация российских и индийских университетов
25. Ассоциация Глобальные университеты – российская
26. Академический консорциум (ТГУ, ЮФУ ИП РАН)
27. Международный совет музеев (ИКОМ)

• Центр исследований в области биоты, климата, ландшафта
  (Научный руководитель: Кирпотин С.Н.)

Сотрудничество:

• Национальный исследовательский Томский политехнический университет
• Институт мониторинга климатических и экологических систем (ИМКЭС) СО РАН
• Сибирский научно-исследовательский институт сельского хозяйства и торфа (СибНИИСХиТ)

• Центр фундаментальной и математической физики
  (Научный руководитель: Багров В.Г.)

Сотрудничество:

• Национальный исследовательский Томский политехнический университет
• Томский государственный педагогический университет

• Центр полупроводниковых материалов и технологий
  (Научный руководитель: Чулков Е.В.)

Сотрудничество:

• Национальный исследовательский Томский политехнический университет
• Томский государственный университет систем управления и радиоэлектроники
• Институт физики прочности и материаловедения СО РАН

• Центр высоких технологий в области медицины
  (Научный руководитель: Кистенев Ю.В.)

Сотрудничество:

• Сибирский государственный медицинский университет
• Институт физики прочности и материаловедения СО РАН
• Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук

• Международный центр исследований развития человека
  (Научный руководитель: Ковас Ю.В.)

Сотрудничество:

• Сибирский государственный медицинский университет
• Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук

• Центр материалов и технологий космического применения
  (Научный руководитель: Дунаевский Г.Е.)

Сотрудничество:

• Акционерное общество «Научно-производственная фирма «Микран»
• Томский государственный университет систем управления и радиоэлектроники

• Центр исследований в области материалов и технологий
  (Научный руководитель: Курзина И.А.)

Сотрудничество:

• Национальный исследовательский Томский политехнический университет
• Институт физики прочности и материаловедения СО РАН

• Центр «Интеллектуальные технические системы»;
  (Научный руководитель: Сырямкин В.И.)

Сотрудничество:

• Институт сильноточной электроники СО РАН
• Национальный исследовательский Томский политехнический университет
• Томский государственный университет систем управления и радиоэлектроники;

• НОЦ теоретических и прикладных региональных исследований;
  (Научный руководитель: Шевелёв Д.Н.)

Сотрудничество:

• Томский государственный педагогический университет
• Томский государственный архитектурно-строительный университет